Строительство храма в честь апостолов Петра и Павла в п. Аршан начато в середине 1990-х годов под руководством священника Александра Василенко, окормлявшего в то время Тункинский район. Небольшой бревенчатый храм был построен в 1997 г.
В 1999 г. община храма зарегистрировала приход как юридическое лицо.
Учредителями выступили:
- Василенко Александр Владимирович (священник)
- Белозерова Екатерина Николаевна (церковная староста)
- Воронина Валентина Ивановна
- Казарина Тамара Михайловна
- Кутякова Татьяна Михайловна
- Михайлишина Зоя Ивановна
- Подлосинская Александра Осиповна
- Подлосинский Михаил Леонтьевич
- Попова Евдокия Игнатьевна
- Фаркова Валентина Петровна
- Шехина Александра Дмитриевна
С 2000 по 2002 г. настоятелем прихода был священник Леонид Никифоров.
С 19.08.2002 г. по май 2005 г. настоятель – священник Сергий Пеньков.
С 11.11.2005 г. до 30.12. 2020 г. настоятель – о. Леонид Никифоров
С 01.01.2021 г. настоятель – священник Иоанн Братенков.
Помощник настоятеля (староста) с 2002 г. Усольцева Любовь Николаевна.
Храм освящен архиерейским чином в престольный праздник 12 июля 2002 года епископом Читинским и Забайкальским Евстафием (Евдокимовым).
В 2006 г. на территории прихода был построен небольшой брусовой домик (4х4 м.) для священнослужителя.
В 2008 г. к храму пристроена колокольня. 08.08.2008 г. были установлены колокола на звоннице. Все это было сделано стараниями протоиерея Калинника Подлосинского, родившегося в п. Аршан, а в настоящее время являющегося настоятелем Михайло-Архангельского храма г. Иркутск.
24.06.2013 г. за алтарной частью храма был установлен поклонный крест.
Примерно в это же время было начато строительство большого приходского дома из бруса (10х10 м)